PyMOLでαヘリックスをシリンダー表示

αヘリックスが目立つタンパク質を表示する場合，詳細よりも全体像を把握するためにヘリックスをざっくりとした筒（シリンダー）で表示するとすっきりすることがあります。このシリンダー表示をPyMOLで行う方法です。

PyMOL>set cartoon_cylindrical_helices, 1

[,w120] → [,w120]

ヘリックス以外の部分（βシートとループ）もすっきりさせるには次のようにします。

PyMOL>set cartoon_fancy_sheets, 0
PyMOL>set cartoon_smooth_loops, 1

[,w120] → [,w120] → [,w120]

[,w120] → [,w120] → [,w120]

う〜ん。２枚目と３枚目の違いはあまりわかんないですけどね。気になる人にはなる，くらいで。詳しくはPyMOL Wikiへ。