αヘリックスが目立つタンパク質を表示する場合，詳細よりも全体像を把握するためにヘリックスをざっくりとした筒（シリンダー）で表示するとすっきりすることがあります。このシリンダー表示をPyMOLで行う方法です。 PyMOL>set cartoon_cylindrical_helices,…

PyMOLでタンパク質を虹色に塗る場合には，マウスだと「C」メニューから「spectrum > rainbow」と選びますが，これをコマンドでやる方法などについてです。 このタンパク質（↓）を例に見ていきましょう。紫色の球はイオンです。 [,w120] 基礎編 虹色にする場…

PyMOLを作っていたWarren L. DeLano氏が亡くなりました。もう２ヶ月くらい前のことなのですが，あまり日本語で情報が出ていないようなのでここに書かせていただきます。 [,w120] PyMOLはタンパク質や化合物の三次元構造を表示するためのソフトウェアで，構造…