αヘリックスが目立つタンパク質を表示する場合，詳細よりも全体像を把握するためにヘリックスをざっくりとした筒（シリンダー）で表示するとすっきりすることがあります。このシリンダー表示をPyMOLで行う方法です。 PyMOL>set cartoon_cylindrical_helices,…

PyMOLでタンパク質を虹色に塗る場合には，マウスだと「C」メニューから「spectrum > rainbow」と選びますが，これをコマンドでやる方法などについてです。 このタンパク質（↓）を例に見ていきましょう。紫色の球はイオンです。 [,w120] 基礎編 虹色にする場…

MeCabをインストールしたのでそのメモです。MeCabの公式サイトと『Pythonによる日本語自然言語処理』を参考にさせていただきました。OSはMac OS 10.6です。 MeCabのインストール（mecab-0.98） $ ./configure --with-charset=utf8 $ make $ sudo make instal…